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ATAC-seq出来的结果,和传统方法出来的结果具有很强的一致性 ,同时也和基于组蛋白修饰marker的ChIP-seq有较高的吻合程度 。也就是说,ATAC-seq中的peak,往往是启动子、增强子序列 ,以及一些反式调控因子结合的位点。
相比起来,ATAC-seq的重复性,比MNase-seq和DNase-seq的更强 ,操作起来也更加简单,而且只需要很少的细胞/组织量,同时出来的信号更加漂亮。目前已经是研究染色质开放性首选的技术方法 。
ATAC-seq技术流程
ATAC-seq技术应用
重大疾病发病机制:癌症、生殖系统 、糖尿病等疾病发病机制;
药物相关研究:药物作用机制、新药研发、耐药性及敏感性研究;
潜在标志物预测:临床生物标志物发现 、生物标志物功能研究;
染色体结构研究:染色体开发性图谱绘制、核小体定位预测、转录因子结合位点分析。
任喜梅? | 文案
楼上错得够离谱的。
线粒体是细胞呼吸(或者说能量代谢)的主要场所 ,细胞活动需要称为ATP的能量物质,这种物质主要就是线粒体生成的 。
染色体是细胞分裂的时候形成的,平时细胞核内没有染色体 ,仅仅是由DNA和蛋白分子构成的线状物质,这种物质能够在特殊染色技术下染上颜色且永不褪色,称为染色质。染色体是染色质在细胞分裂时期浓缩卷曲形成的能够被光学显微镜看到的有特殊形态的棒状物体。
DNA:化学成分为脱氧核糖核酸,由一些特殊核苷酸分子按照特定顺序排列形成的大分子 ,一般呈特殊的双螺旋状。是遗传的物质基础
基因:指DNA序列上有遗传效应的特定片段
关于“科普讲堂 | ATAC-seq:染色质开放性测序技术”这个话题的介绍,今天小编就给大家分享完了,如
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